La Presidència de la Xarxa Vives és semestral i rotatòria, per acord del Consell General de la Xarxa. Els rectors de les universitats van decidir, en gener de 1998, que la presidència de la institució seguira un torn establert i ratificat per l’òrgan esmentat en cada canvi de presidència. La universitat que presideix la Xarxa esdevé el punt de referència de les activitats fonamentals, i l’agent principal de la representació institucional de l’associació al llarg del semestre de durada de la presidència.